Patriotisk Selskab er organiseret i en afdeling med Direktion, Sekretariat, Bogholderi, HR, IT, Udviklingsfunktion, en Økonomiafdeling, en Planteavlsafdeling samt en Husdyr- og Miljøafdeling.
Hver afdeling ledes af en chefkonsulent/afdelingsleder. Chefkonsulenter, afdelingsledere og direktion udgør den samlede ledergruppe.
Patriotisk Selskab er ISO-9001:2008 certificeret.